Humaan Immunodeficiëntie Virus (HIV) is in staat om ons immuunsysteem te infecteren en kan leiden tot AIDS. De huidige behandelingen kunnen de voortgang van de HIV-infectie stoppen maar bieden geen volledige genezing aangezien steeds een kleine fractie inactief HIV buiten het bereik van de medicatie blijft, het zogenaamde ‘latente reservoir’. Indien een behandeling wordt onderbroken, kan hierdoor al binnen enkele weken een rebound van de infectie optreden. De nood aan een definitieve behandeling is dringend en zou wereldwijd 36,9 miljoen HIV-positieve mensen kunnen genezen. Het doel van dit project is om een nieuwe test te ontwikkelen die toelaat om het virus op te sporen en te karakteriseren bij een geïnfecteerde patiënt, de spreekwoordelijke naald in een hooiberg. De eerste stap is het selectief identificeren van geïnfecteerde cellen en het amplificeren van de DNA-gebieden waarin HIV zich heeft verborgen ('naald'), waarbij het ongewenste niet-aangetaste DNA ('hooiberg') wordt verwijderd. Vervolgens maken we gebruik van een nieuwe technologie, long-read sequencing, die toelaat om informatie te verzamelen over de verschillende virussen die in de vorige stap werden gevonden. Onze test zou full-length HIV-1 sequenties tesamen met hun locatie binnen het human genoom opleveren wat nu wordt uitgevoerd met meerdere dure en arbeidsintensieve testen. Kortom, we stellen een nieuwe, innovatieve strategie voor die een grote troef zou zijn in het onderzoek naar HIV-cure.