Tot 80 % van alle bacteriën en archaea op aarde leven in microbiële aggregaten. Aggregaten, of biofilms, zijn een cruciaal onderdeel geworden van energie herwinning en afval-verwerkingstechnologieën zoals anaerobe vergistingsinstallaties (omzetting van afval naar biogas). Wanneer stress wordt uitgeoefend op een biofilm, lost deze actief specifieke micro-organismen in het milieu. Dit mechanisme biedt groot potentieel voor het anticiperen en voorkomen van het verlies van functionele biomassa. Om beter te kunnen verstaan hoe deze dispersie werkt en wat de eigenschappen van deze uitgestoten micro-organismen zijn, zal ik in dit onderzoek hun fenotypische kenmerken bestuderen. In eerste instantie zal ik focussen op anaerobe granulen als modelsysteem. Door het integreren van fenotypische informatie verkregen dankzij flow cytometrie met transcript- en proteoom informatie, zal een dispersie fingerprint worden verkregen. Vervolgens zal ik onderzoeken of deze fingerprint kan gebruikt worden voor het monitoren van biotechnologische systemen. Finaal zal de dispersie fingerprint van biofilms uit verschillende ecosystemen worden vergeleken, om op die manier een gedetailleerd beeld te vormen van al de feno- en genotypische eigenschappen die gerelateerd kunnen worden tussen de ecosystemen. Deze kennis zal het mogelijk maken om flow cytometrie-gebaseerde monitoring toe te passen als kost-efficiënte en snelle manier om biotechnologische systemen te sturen naar een stabiele microbiologie.