Project

Moleculaire karakterisering van Atrichum angustatum als nieuw model systeem voor de studie van vaatweefselontwikkeling en evolutie

Code
3G000622
Looptijd
01-01-2022 → 31-12-2025
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor-woordvoerder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Single-cell data analysis
    • Plant cell and molecular biology
    • Plant morphology, anatomy and physiology
    • Transcriptomics
Trefwoorden
nieuwe plantenmodelsoorten
 
Projectomschrijving

Binnen de enorme diversiteit aan planten op aarde, wordt er een belangrijk onderscheid gemaakt in vaatweefsel en niet-vaatweefselplanten. De aanwezigheid van geleidingsweefsel is echter geen simpel binair gegeven, aangezien sommige mossen (niet-vaatweefsel planten) wel degelijk geleidend weefsel bezitten dat op moleculair vlak kan vergeleken worden met dat van vaatweefselplanten. Toch hebben we slechts een heel beperkt moleculair begrip over de transitie van niet-vaatweefsel naar vaatweefselplanten. Daar bovenop bevatten de beschikbare modelsystemen voor moleculair biologische toepassingen (P. patens en M. polymorpha) niet alle functioneel homologe weefsels, wat het onderzoek naar vaatweefselontwikkeling en evolutie sterk hindert. In dit onderzoeksproject schuiven we het mos Atrichum angustatum naar voor als ideaal modelsysteem om vaatweefselontwikkeling en evolutie te bestuderen door i) het genoom te assembleren en annoteren; ii) protocollen te ontwikkelen voor propagatie/transformatie en een basis set moleculaire vectoren; iii) het genereren en valideren van hoge resolutie transcriptoomdata; en iv) het ontwikkelen van een digitaal platform om deze informatie doorzoekbaar en publiek toegankelijk te maken. De resultaten van dit onderzoeksproject zullen nieuwe inzichten verschaffen over de evolutie van vaatweefsel en het tot stand komen van specifieke celtypes; en op hetzelfde moment ook een belangrijk naslagwerk vormen voor een brede kring van evo-devo wetenschappers.