Er is toenemend bewijs dat het darm-microbioom bijdragen aan het ontstaan en de progressie van darmkanker. Dit doctoraatsonderzoek richt zich op het ontrafelen van oncogene epitheel-microbioom interacties door tumor-gebonden en intratumorale micro-organismen te isoleren uit humaan darmkanker-weefsel. De geïsoleerde bacteriën en fungi zullen in vitro worden gescreend op hun genotoxisch potentieel met behulp van cellijnen en geavanceerde intestinale organoïd-culturen, inclusief innovatieve intra-organoïd injecties en expressie-analyses. Geselecteerde oncogene bacteriën en fungi zullen vervolgens in vivo worden gevalideerd op hun tumorbevorderende eigenschappen met behulp van twee transgene muismodellen van darmkanker, inclusief gnotobiotische experimenten waarbij kiemvrije transgene muizen gekoloniseerd worden met kandidaat-oncobacteriën. Moleculaire mechanismen die aan de basis van deze interacties liggen, worden onderzocht met behulp van geavanceerde cellulaire en moleculaire assays, aangevuld met metabolomics-analyses. Tot slot zullen we met een geavanceerd metastatisch model van darmkanker, d.m.v. injectie van tumororganoïden in de darm, onderzoeken of specifieke tumor-geassocieerde bacteriën de metastatische progressie beïnvloeden. Dit onderzoek is essentieel om microbioom-gedreven mechanismen in darmkanker te ontrafelen en potentieel nieuwe microbiële doelwitten en therapeutische strategieën voor de preventie en behandeling van darmkanker te identificeren.