Project

Het mycologisch herbarium van Universiteit Gent: een waardevolle bron van informatie verstopt in dozen

Code
1512719N
Looptijd
01-01-2019 → 31-12-2019
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Microbiology
    • Systems biology
  • Medical and health sciences
    • Laboratory medicine
    • Microbiology
    • Laboratory medicine
    • Laboratory medicine
    • Microbiology
Trefwoorden
mycologisch herbarium
 
Projectomschrijving

Mycologen analyseren nu fungale gemeenschappen routinematig rechtstreeks vanuit de bodem met behulp van
metagenomica. Om deze omgevingsreeksen te koppelen aan echte soorten, is deze solide taxonomisch
er is een raamwerk nodig waarmee sequentiegegevens kunnen worden vergeleken. Zoals de meeste ecosystemen wereldwijd,
tropische en subtropische Afrikaanse bossen zijn afhankelijk van ectomycorrhiza-associaties, vaak met
schimmels die paddestoelen vormen. Dit project wil bijdragen aan de kennis van de diversiteit in
deze ecosystemen door een referentiekader voor de Afrikaanse ectomycorrhiza-schimmel te construeren
geslachten, gebruikmakend van een schat aan verborgen informatie: het schimmelherbarium van de Universiteit Gent.
Het schimmelherbarium bevat meer dan 35.000 collecties, waarvan minstens 5000 Afrikaans zijn. De
de meerderheid van de specimens en de bijbehorende gegevens is niet gedigitaliseerd en dus verborgen voor onderzoek. Wij
streven naar digitalisering van de Afrikaanse collecties en de bijbehorende gegevens, bieden de 1000 belangrijkste
collecties met een DNA-barcode en deze gegevens publiek beschikbaar maken op verschillende portals. Samen
met onze medewerkers zullen we deze informatie combineren met bestaande gegevens en fylogenieën, om
een uitgebreid taxonomisch raamwerk bouwen voor Afrikaanse ectomycorrhiza-genera. Zo'n
referentiekader zal metagenomische studies naar een hoger niveau tillen.