Project

Analyse van de posttranslationele controle van SOMBRERO, een belangrijke transcriptiefactor van geprogrammeerde celdood in planten

Code
1231223N
Looptijd
01-10-2022 → 30-09-2024
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Cell death and senescence
    • Plant cell and molecular biology
    • Plant developmental and reproductive biology
    • Plant morphology, anatomy and physiology
Trefwoorden
Geprogrammeerde celdood
 
Projectomschrijving

De Arabidopsis NAC transcriptiefactor SOMBRERO (SMB/ANAC033) is een belangrijke regulator van wortelkapdifferentiatie. SOMBRERO wordt onmiddellijk na de vorming van de wortelkapstamcellen tot expressie gebracht en reguleert de differentiatie van stamcellen naar de wortelkap. SMB controleert ook geprogrammeerde celdood (PCD) en post-mortem verwijdering van wortelkapcellen. Ik hypothiseer dat posttranslationele regulatie de SMB activiteiten regelt. Aangezien SMB differentiatie verschillende stappen doorloopt, veronderstel ik dat deze regulatie op verschillende vlakken gebeurt waaronder via fosforylatie en regulatie van interactiepartners. Het belang van SMB fosforylatie wordt ondersteund door onze preliminaire data en eerdere beschrijvingen van fosforylatie afhankelijke activiteiten door andere NAC eiwitten. In dit project ga ik het fysiologisch belang van de SMB fosfo-plaatsen bepalen met behulp van overexpressie en smb mutatie complementatie testen. SMB interactors ga ik identificeren via wortelkap specifieke proximity labelling om zo de invloed van SMB op zijn interactiepartners te bepalen. Daarna ga ik deze SMB interactors onderzoeken met behulp van gain- en loss-of-function toepassingen. Inzicht in de regulatie van SMB laat toe om de basismechanismen van differentatie en PCD te ontrafelen. Hiervoor is de Arabidopsis wortelkap een krachtig modelsysteem voor de algemene PCD mechanismen die door NAC transcriptiefactoren geregeld worden zoals xyleem en veroudering.