Project

Opheldering van de regulatie van secundaire metabolietclusters in niet-conventionele gisten: soforolipidesynthese door Starmerella bombicola als een case study

Code
3F004820
Looptijd
01-11-2020 → 31-10-2024
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Bioinformatics data integration and network biology
    • Computational transcriptomics and epigenomics
    • Genome structure and regulation
  • Engineering and technology
    • Industrial microbiology
    • Industrial molecular engineering of nucleic acids and proteins
Trefwoorden
Transcriptionele regulatie Soforolipiden Multi-omics analyse Sophorolipiden
 
Projectomschrijving

Fungale secundaire metabolieten omvatten een brede waaier aan bio-actieve en industrieel relevante moleculen. De genen voor de enzymen voor de biosynthese van deze moleculen liggen meestal samen in biosynthetische genclusters (BGCs). Ondanks de reeds verworven inzichten blijft de transcriptionele regulatie van deze BGCs slecht begrepen, wat de valorisatie van de overeenkomstige moleculen tegenhoudt. De oorzaak hiervoor is tweeledig, aangezien slechts enkele beïnvloedende factoren onderzocht zijn en ook het aantal bestudeerde taxa zeer beperkt is, met een groot gebrek aan studies in niet-conventionele gisten, ondanks de productie van interessante en relevante biochemicaliën door BGCs van niet-conventionele gisten. Een goed voorbeeld zijn de sophorolipiden (SL), industrieel relevante biochemicaliën, van de niet-conventionele gist Starmerella bombicola. De SL BGC zal in dit project bestudeerd worden als een case study om de regulatie van BGCs beter te begrijpen. Hiervoor zullen hoog-dimensionele omics data verzameld worden gerelateerd met de regulatie van SL biosynthese, voorheen onderbelichte mechanismes zullen onderzocht worden. De verworven kennis zal een positieve impact hebben op de biosurfactant markt en de biogebaseerde economie in het algemeen.