Project

Multi-omics voor de identificatie van biomerkers in vloeibare biopten van patiënten met gevorderd pancreaskanker door baanbrekende single cell massaspectrometrie van CTCs en (epi)genetische karakterisatie van cfDNA

Code
BOF/24J/2023/165
Looptijd
01-10-2023 → 30-09-2027
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Cancer therapy
    • Clinical genetics and molecular diagnostics
    • Molecular diagnostics
    • Protein diagnostics
Trefwoorden
single cell massa spectrometry cfDNA: genetisch en epigenetische variaties alvleesklierkanker vloeibare biopsieën
 
Projectomschrijving

Alvleesklierkanker is een dodelijke ziekte en chirurgie is de enige kans op genezing. Bij patiënten met gevorderde kanker oordelen de chirurgen op basis van beeldvorming en CA19-9 wie baat zou kunnen hebben bij een operatie, maar bij 40% wordt vroegtijdig herval en uitzaaiingen gezien. Wij stellen een multi-omics aanpak voor om in vloeibare biopten biomarkers te identificeren met hogere nauwkeurigheid, gevoeligheid en specificiteit. Deze omvat proteomics van circulerende tumorcellen (CTCs) en (epi)genomics in cfDNA. We zetten een nieuwe workflow op voor aanrijking van CTCs uit bloed gevolgd door single cell massaspectrometrie. Longitudinale analyse van (epi)genetische veranderingen in cfDNA zal inzicht geven in welk percentage van de patiënten detecteerbare (epi)genetische afwijkingen voorkomen in verschillende stadia van hun ziekte en of dit de prognose beïnvloedt. Combineren van informatie op genoom- en proteoomniveau zal op lange termijn de diagnostische specificiteit verbeteren.