De wereldwijde vraag naar verse en minimaal bewerkte groenten en fruit is aanzienlijk toegenomen, wat heeft geleid tot toenemende bezorgdheid over microbiële besmetting en voedselgerelateerde ziekten. Hoewel conventionele beheersstrategieën op basis van chemische fungiciden nog steeds veel worden toegepast, worden ze steeds vaker als onhoudbaar beschouwd vanwege problemen zoals resistentie tegen pesticiden, milieuvervuiling en potentiële gezondheidsrisico's.

Als duurzaam alternatief bieden biocontrolestrategieën, waarbij gebruik wordt gemaakt van natuurlijke antagonisten—zoals bacteriën, gisten en bacteriofagen—een gerichte onderdrukking van pathogenen, terwijl de ecologische balans behouden blijft.

In Zuid-Korea zijn Shine Muscat-druiven en oosterse meloenen economisch belangrijke tuinbouwgewassen. Door hun beperkte houdbaarheid en hoge gevoeligheid voor microbiële bederfprocessen treden echter aanzienlijke verliezen op na de oogst.

Het ontwikkelen van doeltreffende biocontrolebehandelingen is daarom essentieel om microbiële besmetting te verminderen en de postharvestkwaliteit en verhandelbaarheid van deze gewassen te verbeteren.

In dit project streven we ernaar om antagonistische endofytische micro-organismen—met name bacteriestammen zoals Bacillus spp. en melkzuurbacteriën (LAB)—te isoleren en te karakteriseren uit Shine Muscat-druiven en oosterse meloenen afkomstig van lokale markten. Tegelijkertijd zullen schimmelpathogenen worden geïsoleerd uit vruchtmonsters die bederfverschijnselen zoals verkleuring of laesies vertonen.

De remmende activiteit van de geïsoleerde endofyten tegen deze schimmelpathogenen zal worden geëvalueerd via in vitro antagonistische tests op agarplaten, als eerste beoordeling voorafgaand aan in vivo-proeven op vers fruit.

Bovendien maken recente ontwikkelingen in nanopore-sequencing een uitgebreide analyse van de dynamiek binnen de schimmelgemeenschap mogelijk als reactie op biocontrolebehandelingen. Met behulp van deze technologie willen we verschuivingen in de schimmelmicrobiota van behandeld fruit monitoren, wat een breder inzicht biedt in de impact van biocontrole, voorbij de individuele doelpathogenen.

Uiteindelijk zullen verdere experimenten het potentieel van deze endofytische bacteriën evalueren om bederf vóór de oogst van Shine Muscat-druiven en oosterse meloenen onder praktijkomstandigheden te verminderen.