Project

Fotolitografische DNA printer voor massaal parallelle synthese van DNA oligonucleotiden voor ruimtelijke -omics en hybrid capture target enrichment toepassingen

Code
I004824N
Looptijd
01-05-2024 → 30-04-2028
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor-woordvoerder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Computational transcriptomics and epigenomics
  • Medical and health sciences
    • Cancer biology
  • Agricultural and food sciences
    • Crop science
    • Veterinary anatomy, morphology and (clinical) pathology
Trefwoorden
ruimtelijke transcriptomica en genomica
 
Projectomschrijving

Recente technologie helpt ons complexe levende systemen, zoals mensen, dieren en gewassen, beter
te begrijpen door hun genetische informatie en expressie te bestuderen. We hebben variaties tussen
cellen ontdekt en zelfs nieuwe celtypen geïdentificeerd.
De huidige technologie heeft echter beperkingen. Het mist gevoeligheid, waardoor belangrijke
informatie ontbreekt, en het is duur en tijdrovend. Verder worden nieuwe toepassingen, zoals het in
kaart brengen van genetische veranderingen en het bestuderen van specifieke DNA-modificaties, niet
ondersteund.
Om deze uitdagingen aan te pakken, stellen we voor om apparatuur aan te schaffen die op maat
gemaakte materialen kan produceren voor genetische analyse. Zo'n fotolithografische printer kan
duizenden DNA-moleculen met hoge resolutie creëren. Deze moleculen kunnen worden gebruikt om
microscoopglaasjes te maken met specifieke DNA-patronen, waardoor gedetailleerde genetische
analyse van weefsels mogelijk is. De DNA-moleculen kunnen ook worden vrijgegeven voor analyse in oplossing.
Met deze technologie kunnen we grote weefselgebieden bestuderen en genetische informatie op
cellulair niveau analyseren. Het maakt ook onderzoek mogelijk naar organismen waarvoor geschikte
tools ontbreken. Bovendien vergemakkelijkt het de studie van verschillende RNA-moleculen,
waaronder belangrijke maar vaak over het hoofd geziene moleculen zoals niet-gepolyadenyleerde
lange niet-coderende RNA's.