Het tegengaan van het verlies aan biodiversiteit vormt een van de bepalende uitdagingen van onze tijd.
Afwijkingen van amfibieën zijn iconisch geworden voor wereldwijde uitstervingen en twee dodelijke pathogene chytriden
schimmels - Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) en B. salamandrivorans (Bsal) - zijn betrokken bij
de belangrijkste factoren die hun ondergang bepalen. De eerste veroorzaakte uitgebreide uitroeiing bij kikkers, maar de
laatstgenoemde is recent ontstaan ​​en veroorzaakt momenteel ongekende afsterven in Europees vuur
salamanders (Salamandra salamandra) na een invasie vanuit Oost-Azië, met het potentieel om
wereldwijd salamander-diversiteit decimeren. In de bekende uitbraakplaatsen, een klein deel van
individuen blijven bestaan. De aanpassingsmechanismen begrijpen die bestaande populaties mogelijk maken
aanhouden na de invasie van ziekteverwekkers is de sleutel tot het ontwerpen van instandhoudingsmaatregelen. Hier stellen we een
integratieve gen-tot-ecosysteemstudie om de factoren te onderzoeken die ten grondslag liggen aan salamanderpersistentie,
koppeling gastheer genetische, fenotypische en ecologische differentiatie door middel van analyses van RNA-sequentie
en expressiegegevens, huidverdediging en ruimtelijke populatiestructuur. Verder zullen we ons ontwikkelen
en een nieuwe genotyperingstest toe te passen voor Bsal om de diversiteit en frame-resultaten in de genetische kaart in kaart te brengen
context van de ziekteverwekker, en presenteren een directe bron voor efficiënte wereldwijde monitoring van de
ziekte. Deze doelstellingen behandelen elk openstaande vragen over de evolutie van Bsal-gastheerpathogenen,
maar bieden samen een uitgebreid verslag van het aanpassingsvermogen van salamander.