Project

Het regulatorische landschap van SATB2: naar een verbeterde genetische diagnose en therapie voor SATB2-geassocieerd syndroom

Code
11I2523N
Looptijd
01-11-2022 → 31-10-2024
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Clinical genetics and molecular diagnostics
    • Genetics
    • Developmental neuroscience
Trefwoorden
SATB2-geassocieerd syndroom
 
Projectomschrijving

Het SATB2-geassocieerde syndroom (SAS) is een autosomaal dominante aandoening die wordt veroorzaakt door functieverlies van SATB2 & wordt gekenmerkt door ontwikkelingsachterstand/intellectuele achterstand met afwezige of beperkte spraakontwikkeling, palatale en tandafwijkingen, voedingsproblemen, gedragsproblemen & waarneembare gelaatstrekken. Er zijn reeds verschillende gevallen gemeld met een gebalanceerde chromosomale aberratie (BCA) 3’ gelegen van SATB2. Al deze individuen vertonen klinische kenmerken van SAS. We veronderstellen daarom dat deze BCAs invloed hebben op SATB2-regulerende elementen & daardoor zouden kunnen leiden tot SATB2-haploinsufficiëntie. Om de functionele impact van niet-coderende structurele variatie in deze locus volledig te begrijpen, is een gedetailleerde mechanistische ontleding van deze locus en zijn functionele elementen vereist. Daarom zullen we een diepgaande functionele karakterisering & validatie van het regulatoire landschap van SATB2 uitvoeren. Verder zullen we het effect van deze BCAs op 3D-chromatinestructuur & SATB2-expressie beoordelen. Met behulp van deze nieuw verworven kennis zullen we vervolgens het potentieel beoordelen van cis-regulatietherapie (CRT) gericht op de gevalideerde enhancer-elementen in iPSC-gedifferentieerde cellijnen van patiënten met een pathogene SATB2-coderende variant. In het algemeen zullen we in dit project het regulatoire landschap van SATB2 bepalen & het potentieel van CRT in deze locus voor SAS beoordelen.