Project

Functie, organisatie, dynamica en evolutie van hypervertakte receptor-bindende proteïnen in Klebsiella jumbo bacteriofagen

Code
DOCT/011868
Looptijd
15-03-2024 → 21-09-2025 (Lopend)
Doctoraal onderzoeker
Onderzoeksdisciplines
  • Engineering and technology
    • Medical biotechnology not elsewhere classified
Trefwoorden
jumbofagen Receptorbindende eiwitten Klebsiella pneumoniae
 
Projectomschrijving

De meest intense co-evolutie op onze aarde vindt plaats tussen bacteriën en hun virussen, met name
bacteriofagen. Bacteriofagen doden hun bacteriële gastheer met een zeer hoge specificiteit. Elke
faaginfectie start door de herkenning van een specifieke structuur op de bacteriële celwand door een
receptor-bindend proteïne (RBP). Sommige fagen hebben slechts één RBP en infecteren daarom
slechts één serotype, terwijl andere fagen vele gastheren kunnen afdoden met verschillende RBPs.
Jumbofagen zijn bijzonder groot en bezitten talrijke RBPs in een complexe organisatie waarmee ze
vele bacteriële serotypes kunnen afdoden. Daarom zijn ze ook zeer interessant voor therapie.
Faagtherapie is een lang-gekend concept, maar herwint nu sterke interesse om multidrug-resistente
bacteriële infecties te behandelen. De meeste jumbofagen zijn nog maar pas ontdekt en zijn nog
grotendeels onbekend. Eén van de belangrijkste aspecten is de complexe organisatie van de
hypervertakte RBP structuur, de functie en evolutie ervan, en hoe de bacteriële gastheer reageert op
jumbofagen in vergelijking met eenvoudige fagen. We zullen deze aspecten bestuderen voor twee
specifieke Klebsiella jumbofagen op drie niveaus: het proteïneniveau, het faagniveau en de interactie
tussen bacterie en faag. We gebruiken hiervoor geavanceerde moleculaire microbiologie,
synthetische biologie en structurele biologie.