Project

Computationele genoomannotatie met behulp van next-generation transcriptoomdata.

Code
3E022610
Duration
01 October 2010 → 31 October 2014
Funding
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO), Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Research disciplines
  • Natural sciences
    • Scientific computing
    • Bioinformatics and computational biology
  • Medical and health sciences
    • Bioinformatics and computational biology
    • Bioinformatics and computational biology
    • Public health care
    • Public health services
    • Bioinformatics and computational biology
  • Engineering and technology
    • Scientific computing
Keywords
rna-seq next-generation sequencing annotation gene finding
 
Project description

In dit project gaan we RNA-seq data gebruiken voor het annoteren van genomen. De recente ontwikkeling van nieuwe sequentiemethodes heeft een schat aan sequentiedata opgeleverd. Voorlopig zijn er nog geen annotatiemethodes beschikbaar die hier optimaal gebruik van maken. Dit project streeft ernaar om dergelijke annotatiemethodes te ontwikkelen. Genoomannotatie is ontzettend belangrijk aangezien alle daaropvolgende bioinformatica analyses afhankelijk zijn van de kwaliteit van de annotatie.