-
Natural sciences
- Systems biology
- Other biological sciences
Epigenetische modificaties van chromatine zijn van essentieel belang in de regulatie van vele biologische processen. De evolutionair geconserveerde histon eiwitten die nauw verbonden zijn met DNA de chromatine staan centraal epigenetische substraten hierin. De amino-terminale staart van deze histonen uitsteekt uit het nucleosoom kan raken en aangepast door verschillende posttranslationele modificaties aan tenminste 60 verschillende groepen. Er is echter een soort van PTM slechts weinig aandacht gekregen in de epigenetica tot nu toe: proteolytische histone knippen. Hier presenteren we een nieuw project door de rol en impact van histon verwerking opheldering te differentiëren humane embryonale stamcellen (hESC) en zijn rol in geïnduceerde pluripotentie. Alle experimenten op hESC zal worden uitgevoerd op de G1 cellijn die werd gegenereerd door het Departement voor Reproductieve Geneeskunde (Universitair Ziekenhuis Gent). Eerst zal translocatie enzym en de activiteit in de nucleus en chromatine-brede verdeling van het knippen gebeurtenissen worden gevolgd door fluorescentiemicroscopie. Ten tweede zal het effect van het remmen van deze epigenetische evenement worden gecontroleerd op het transcriptoom niveau. Ten derde zal ChIPseq analyse van de genen die het doelwit zijn van deze histon knippen definiëren. Tenslotte zal histon knippen in geïnduceerde pluripotente stamcellen worden gevolgd.