Project

Fundamentele analyse van nematoden-geïnduceerde plantenrespons

Looptijd
01-10-2009 → 30-09-2016
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO), Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Scientific computing
    • Bioinformatics and computational biology
    • Plant biology
  • Medical and health sciences
    • Bioinformatics and computational biology
    • Bioinformatics and computational biology
    • Public health care
    • Public health services
    • Bioinformatics and computational biology
  • Engineering and technology
    • Scientific computing
  • Agricultural and food sciences
    • Agricultural plant production
    • Horticultural production
Trefwoorden
RNA-Seq transcriptoom profiling Meloidogyne graminicola nematoden-infectie Hirschmanniella oryzae rijst
 
Projectomschrijving

In dit project wordt de plantenrespons in rijst na nematoden-infectie bestudeerd met behulp van RNA-seq, een ultramoderne methode voor transcriptoom profiling. Rijst, een modelplant voor de monocotylen en een zeer belangrijk gewas, wordt zowel geïnfecteerd door de sedentaire wortelknobbelnematode Meloidogyne graminicola als de migratorische rijstwortelnematode Hirschmanniella oryzae. De genexpressie na infectie werd zowel lokaal als systemisch in kaart gebracht en de data wordt momenteel geanalyseerd en geïnterpreteerd.