-
Medical and health sciences
- Molecular diagnostics
- Cancer diagnosis
Precisie-oncologie op basis van vloeibare biopsieën vormt de hoeksteen voor het verhogen van de overlevingskansen van kankerpatiënten en het verbeteren van hun levenskwaliteit. Helaas zijn er vandaag onvoldoende methoden beschikbaar voor ultragevoelige (“DEEP”) en betaalbare detectie van somatische mutaties met korte doorlooptijden in het bloedplasma van de patiënt. In het voorgestelde project zal een complementair consortium van experten een innovatieve 'universele' digitale PCR ("DIG") mutatie kwantificatietechnologie ontwikkelen en valideren. Deze technologie zal vervolgens de basis vormen voor verdere ontwikkeling van multiplexing van hogere orde, aangrenzende hotspot-mutaties en de toepassing op circulerend DNA uit vloeibare biopsieën. Om de hogere-orde multiplexing digitale PCR-data te analyseren, zal een nieuw, krachtig algoritme worden ontwikkeld en getest op experimentele data afkomstig van verschillende digitale PCR-platformen. Ten slotte zal een prospectief verzamelde klinische staalcohorte, samen met informatie over de behandelingsrespons, worden gebruikt om de klinische validiteit aan te tonen van het nieuwe precisie-oncologie-instrument voor longitudinale monitoring van private somatische mutaties in het bloedplasma van kankerpatiënten. Als proof-of-principle zal DIG-DEEP zich richten op pancreaskanker en kinderkanker.