Project

DIG-DEEP_ontwikkeling en toepassing van een hoger order universele digitale PCR mutatie detectie technologie voor het monitoren van therapie respons, vroege diagnose of herval bij kankerpatiënten

Code
179V04523
Looptijd
01-06-2023 → 31-05-2026
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: IWT/VLAIO
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Molecular diagnostics
    • Cancer diagnosis
Trefwoorden
kanker hoge orde multiplexing digitale PCR
 
Projectomschrijving

Precisie-oncologie op basis van vloeibare biopsieën vormt de hoeksteen voor het verhogen van de overlevingskansen van kankerpatiënten en het verbeteren van hun levenskwaliteit. Helaas zijn er vandaag onvoldoende methoden beschikbaar voor ultragevoelige (“DEEP”) en betaalbare detectie van somatische mutaties met korte doorlooptijden in het bloedplasma van de patiënt. In het voorgestelde project zal een complementair consortium van experten een innovatieve 'universele' digitale PCR ("DIG") mutatie kwantificatietechnologie ontwikkelen en valideren. Deze technologie zal vervolgens de basis vormen voor verdere ontwikkeling van multiplexing van hogere orde, aangrenzende hotspot-mutaties en de toepassing op circulerend DNA uit vloeibare biopsieën. Om de hogere-orde multiplexing digitale PCR-data te analyseren, zal een nieuw, krachtig algoritme worden ontwikkeld en getest op experimentele data afkomstig van verschillende digitale PCR-platformen. Ten slotte zal een prospectief verzamelde klinische staalcohorte, samen met informatie over de behandelingsrespons, worden gebruikt om de klinische validiteit aan te tonen van het nieuwe precisie-oncologie-instrument voor longitudinale monitoring van private somatische mutaties in het bloedplasma van kankerpatiënten. Als proof-of-principle zal DIG-DEEP zich richten op pancreaskanker en kinderkanker.