Project

Een paradigmaverschuiving in ons begrip van de modulaire complexiteit van faaglysines voor verbeterde antibacteriële middelen

Code
1226526N
Looptijd
01-10-2025 → 30-09-2028
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified
    • Virology
  • Medical and health sciences
    • Microbiology not elsewhere classified
  • Engineering and technology
    • Medical molecular engineering of nucleic acids and proteins
Trefwoorden
antibacterieel faaglysine computationeel eiwitdesign
 
Projectomschrijving
Lysines zijn bacteriofaag-gecodeerde enzymen die de peptidoglycaanlaag van bacteriële celwanden afbreken. Ze vormen een veelbelovend alternatief voor antibiotica, vooral in het kader van de strijd tegen de toenemende antimicrobiële resistentie. Onderzoek naar lysines blijft echter grotendeels empirisch en berust op omslachtige screenings met beperkte generaliseerbaarheid. Dit benadrukt de noodzaak aan fundamentele studies om onopgeloste vragen over de structuur, functie en regulatie van lysines te beantwoorden. In dit project zal ik de regulatiemechanismen en interacties tussen specifieke lysinemodules in hun natuurlijke faagcontext bestuderen, met bijzondere aandacht voor de impact hiervan op de fitness van fagen, en specifiek voor de lysisfase. Ik zal daarbij gebruikmaken van recente technologische vooruitgangen om faaggenomen efficiënt te editeren en de functie van genen en hun structuur-functierelaties te onderzoeken. Deze inzichten zullen leiden tot een paradigmaverschuiving naar een verfijnder begrip van de modulariteit van faaglysines, in tegenstelling tot onze huidige simplistische benadering. Uiteindelijk zal mijn onderzoek bijdragen aan de ontwikkeling van verbeterde antimicrobiële lysines van de volgende generatie, met gescheiden regulerende en lytische functies. Dit biedt een rationelere aanpak voor lysine-onderzoeks- en ontwikkelingsprocessen met verlaagd risico.