De rode draad doorheen mijn onderzoeksprojecten is het gebruik van PBMC epigenetica om nieuwe biomerkers te vinden. Het feit dat multimodale één-cel technologieën nu beschikbaar zijn is zeer waardevol voor mijn projecten. Maar er zijn nog twee grote uitdagingen. Ten eerste, is een goede integratie noodzakelijk om de data ten volle te exploreren, maar het is moeilijk beslissen welke methode de beste is. Ten tweede, de beschikbare PBMC-referenties coveren niet alle leeftijden, terwijl het welgekend is dat het immuunsysteem wijzigt bij verouderen. Daarenboven is er momenteel weinig histone data op PBMCs beschikbaar. Daarom wil ik de meest allesomvattende atlas creëren die zowel transcriptome, oppervlakte merkers, chromatine status en histone data bevat. Ik zal ook de meest optimale integratie strategie bepalen door de beschikbare tools te vergelijken. Het toepassen van de meest optimale strategie op de PBMC-data zal resulteren in een publiek toegankelijk allesomvattende atlas. Ik zal de atlas toepassen in twee van mijn projecten. Met het eerste project wil ik celtypes definiëren die gelinkt zijn met response op behandeling met immuun checkpoint inhibitoren in kankerpatiënten. Met het tweede project wil ik de classificatie van common variable immuundeficiëntie optimaliseren. Ik ben overtuigd dat de PBMC-atlas en geoptimaliseerde integratie strategie mijn projecten zal ondersteunen, maar dat de atlas ook veel waarde heeft voor de onderzoek gemeenschap.