Project

Nodules onder de loep met elektronenmicroscopie – Het ontcijferen van moleculaire interacties ter hoogte van het symbiosoom in de soja-Bradyrhizobium symbiose

Code
01P04124
Looptijd
01-10-2024 → 30-09-2027
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Intracellular compartments and transport
  • Medical and health sciences
    • Molecular biophysics
Trefwoorden
(in situ) cryo-elektronenmicroscopie & tomografie Biologische stikstoffixatie Soja-rhizobia symbiose
 
Projectomschrijving

Stikstoffixatie door rhizobia is een belangrijk proces in het cultiveren van legumineuze gewassen, zoals sojaboon. Soja gaat een symbiotische interactie aan met Bradyrhizobium waarbij de bacteriën worden opgenomen in de nodule, een gespecialiseerd wortelorgaan, en differentiëren tot stikstof-fixerende organellen, de symbiosomen. Hoewel de initiële communicatie bij het vormen van nodules goed bestudeerd is, zijn de moleculaire processen voor nutriëntuitwisseling en communicatie tussen de macro- en microsymbiont niet goed begrepen ter hoogte van het symbiosoom. In dit project zullen verschillende elektronenmicroscopie en biofysische technieken aangewend worden om deze processen te ontrafelen. Hiervoor zal een nieuwe in situ structurele biologie workflow opgezet worden, waarbij nodule cellen en hun symbiosomen ingevroren worden en bestudeerd worden met cryo-elektronentomografie. Deze workflow zal vervolgens toegepast worden om de structurele eigenschappen van het symbiosoom doorheen de ontwikkeling van de nodule en onder nitraat stress te bestuderen. Tenslotte zullen specifieke eiwitcomplexen ter hoogte van de symbiosoom membraan fluorescent gelabeld worden en bestudeerd worden met biofysische methoden, massaspectrometrie en cryo-elektronenmicroscopie om de structurele samenstelling op te helderen. Samen zullen deze technieken ongekende details blootleggen van het nodulatieproces, alsook een nieuw platform bieden voor het (inter)nationaal moleculair plantenonderzoek.