Project

Functionele analyse van Globodera pallida effector eiwitten

Code
01SM2313
Looptijd
01-09-2013 → 30-06-2014
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Agricultural and food sciences
    • Agricultural animal production
    • Agricultural plant production
    • Agriculture, land and farm management
    • Other agriculture, forestry, fisheries and allied sciences
 
Projectomschrijving

Mijn project is gericht op de functie van een familie van effectoren (SPRYSECs) van het aardappelcysteaaltje Globodera pallida te onderzoeken in samenwerking met James Hutton Institute (JHI). Het genoom sequencingproject deze nematode, waarbij JHI een partner is gebleken dat de SPRYSEC genfamilie extreem groot, bestaande uit meer dan 300 leden. Ik heb met 10 SPRYSEC effectoren, uitgedrukt in de invasieve fase jeugdigen, die zich ophopen tot de verschillende afdelingen van de plantencel. Mijn vorige bezoek aan JHI heeft me toegestaan ​​om een ​​scala van verschillende gastheer eiwitten die interageren met de SPRYSECs in de gist twee-hybride systeem wanneer gescreend tegen een cDNA aardappel bibliotheek. Voorlopige resultaten zijn de interacties tussen SPRYSECs en het afgeknotte gastheereiwit bevestigd de gist alsook in gastheerplantencellen. Het plan is om naast deze interacties met volledige lengte interactor eiwitten onder toepassing van verschillende in planta testen zoals co-lokalisatie en split YFP assays controleren. Constructen zijn verkrijgbaar bij JHI die fusies van verschillende nucleolaire en Cajal body markers mRFP. Deze markers samen met de microscopie infrastructuur beschikbaar bij JHI zal een grote hulp voor mijn onderzoek.