-
Natural sciences
- Phytopathology
- Plant biochemistry
- Plant genetics
-
Agricultural and food sciences
- Agricultural plant breeding and biotechnology
De tomaat is één van de hoofd gewassen die de dag van vandaag geteeld wordt en waarvan de productie is bedreigd door de toenemende droogte in vele delen van de wereld. Een voorgestelde oplossing voor dit probleem is het gebruik van AMF, dit omdat de fungus de plant kan voorzien van nutriënten en water op een duurzame manier in het geval van droogte. Dankzij plant pathologie studies weten we reeds dat een pathogeen de plant kan binnendringen door middel van de secretie van kleine effector eiwitten. De genen voor deze eiwitten zijn ook aanwezig in AMF. Echter, weinig is gekend over hun rol tijdens de vorming van de mutualistische interactie. In ons onderzoeksvoorstel zullen we de state-of-the-art riboproteogenomics en innovatieve proteomics techniek BioID toepassen om inzichten te verwerven in het effectoroom van Rhizophagus irregularis en het tomaten wortel proteoom waarmee het interageert. Verder gaan we drie sleutel tomaten wortel eiwitten bestuderen in hun rol bij het re-programmeren van plant groei door middel van een multidisciplinaire aanpak welke phenotypering combineert met moleculaire, fysiologische en biochemische analyses. Onze bevindingen zullen zowel de huidige internationale interesse in AMF effector biologie ten goede komen evenals de tomaten teelt, en dit dankzij de nieuw verworven inzichten in dit mutualisme.