Project

Computationele evolutie voor biologisch ontwerp

Code
BOF/STA/202309/040
Looptijd
01-10-2024 → 30-09-2028
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Neural, evolutionary and fuzzy computation
  • Engineering and technology
    • Other biotechnology, bio-engineering and biosystem engineering not elsewhere classified
Trefwoorden
evolutionaire algoritmes bio-ontwerp synthetische biolgie open-endedness
 
Projectomschrijving

Biologische evolutie heeft geleid tot de enorme diversiteit en complexiteit van de biosfeer. Evolutionair rekenen heeft grote vooruitgang geboekt in het benutten van dit creatieve potentieel. In dit project willen we de volgende generatie evolutionaire algoritmes ontwikkelen voor het ontwerpen van nieuwe biomoleculen, genomische constructies en microbiële gemeenschappen. In plaats van alleen te streven naar verbeterde prestaties, is ons doel om algoritmen te ontwikkelen die in staat zijn tot het creëren van i) nieuwe functionaliteit, ii) verbeteringscapaciteit, iii) toenemende complexiteit en iv) kennisgeneratie. We zullen het algemene computationele raamwerk ontwikkelen, dat we zullen toepassen op een representatieve 'wet lab'-casus binnen de synthetische biologie. Dit project zal in nauwe samenwerking met het Biocompute Lab aan de Universiteit van Bristol worden uitgevoerd, voortbouwend op onze gezamenlijke onderzoekslijn "open-ended evolution for biodesign".