Project

Ontrafelen van het regulatorisch netwerk van ontwikkelingsgestuurde geprogrammeerde celdood in de wortelmuts van Arabidopsis

Looptijd
01-01-2018 → 31-12-2021
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
Niet beschikbaar
 
Projectomschrijving

Geprogrammeerde celdood (PCD) is een overkoepelende term die verschillende vormen van actief beheerst,
genetisch gecodeerde cellulaire zelfmoord. In zowel planten als dieren heeft PCD veel verschillende functies
ontwikkeling en gezondheid. Maar toch, in vergelijking met dieren, de kennis van het moleculaire
mechanismen die PCD in planten regelen, zijn nog steeds zeer beperkt. In het verleden hebben we de root vastgesteld
dop van de referentieplant Arabidopsis thaliana als een nieuw modelsysteem voor ontwikkelingsdoeleinden
gereguleerde PCD (dPCD) in planten. We hebben een score geïdentificeerd van transcriptioneel gereguleerde dPCD-geassocieerde
genen, hoewel de meeste van hun individuele functies raadselachtig blijven. Onlangs hebben we dat gedaan
ontdekte SOMBRERO, LIBITINA1 en LIBITINA2, drie transcriptiefactoren die als sleutel fungeren
regulatoren van dPCD, die noodzakelijk zijn voor regelmatige dPCD-uitvoering in de roottop en voldoende
om ectopisch PCD te veroorzaken bij induceerbare mysispression.
Hier beschrijven we een complementaire benadering van reverse en forward genetica om extra te identificeren
modules van het dPCD-reguleringsnetwerk stroomafwaarts van SOMBRERO, LIBITINA1 en LIBITINA2, en
stroomopwaarts van de score van dPCD-geassocieerde genen. Daartoe hebben we een combinerende strategie bedacht
nieuwste CRISPR-technologie, eiwit-DNA-interactie-assays en een krachtige forward-genetica-mutant
scherm. Het toevoegen van nieuwe modulators aan het nog steeds schematische dPCD-reguleringsnetwerk zal cruciaal zijn voor onze
begrip van PCD als een fundamenteel ontwikkelingsproces in planten.