Project

Het definiëren van moleculaire routes getriggerd door IL-10 en TGFb die HIV-integratie en persistentie in Tfh-cellen in lymfeklieren

Acroniem
NIH Pereira Ribeiro
Code
41M07823
Looptijd
01-07-2023 → 30-06-2025
Financiering
Internationale middelen: wereldwijde instellingen
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Virology
Trefwoorden
besmettelijke ziekten HIV
 
Projectomschrijving

Het HCRC ontvangt in dit project monsters van Emory University (geëxtraheerd DNA en RNA en plasma). Het HCRC zal totaal HIV DNA, intact proviraal DNA assay analyse en CA RNA analyse uitvoeren met behulp van een hogere orde multiplex platform (5 kleuren). HCRC zal single genome sequencing van plasmavirus (SGS) uitvoeren. Daarnaast zal het HCRC -unique modified identifier- nanopore sequencing uitvoeren om bijna volledige sequenties te verkrijgen op semi high throughput wijze. Het HCRC zal MIP-seq uitvoeren voor het evalueren van HIV-integratiesites en daaraan gekoppelde provirale sequenties, of reguliere ISLA wanneer dat nodig is. Tot slot zal het HCRC nieuwe bevindingen valideren door CRISPR-CAS gemedieerde knock-out van nieuwe targets die in dit project kruisgewijs gevalideerd zullen worden.