Project

Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomics

Looptijd
01-11-2020 → Lopend
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Promotor
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Machine learning and decision making
    • Bio-informatics
    • Computational biomodelling and machine learning
    • Single-cell data analysis
Trefwoorden
Machine learning bioinformatica single-cell omics
 
Projectomschrijving

In dit project zullen we nieuwe methoden ontwikkelen om beter de spatiale context binnen weefsels functioneel te gaan karakteriseren. Hierbij beogen we de integratie van single-cell multi-omics (transcriptoom en proteoom), spatiale transcriptoomdata en confocale microscopie. Nieuwe machine learning technieken zullen ontwikkeld worden om de hoge spatiale resolutie van microscopie-technieken te combineren met de diepe phenotyperingscapaciteiten van huidige single-cell omics methoden.