Project

Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomics

Code

01D16720

Looptijd

01-11-2020 → 31-10-2021

Financiering

Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds

Promotor

Yvan Saeys

Mandaathouder

Lotte Pollaris

Onderzoeksdisciplines

Natural sciences
- Machine learning and decision making
- Bio-informatics
- Computational biomodelling and machine learning
- Single-cell data analysis

Trefwoorden

Machine learning bioinformatica single-cell omics

Projectomschrijving

In dit project zullen we nieuwe methoden ontwikkelen om beter de spatiale context binnen weefsels functioneel te gaan karakteriseren. Hierbij beogen we de integratie van single-cell multi-omics (transcriptoom en proteoom), spatiale transcriptoomdata en confocale microscopie. Nieuwe machine learning technieken zullen ontwikkeld worden om de hoge spatiale resolutie van microscopie-technieken te combineren met de diepe phenotyperingscapaciteiten van huidige single-cell omics methoden.