Eiwitten reageren snel op diverse stimuli door hun structuur te veranderen. Onlangs is een op massaspectrometrie (MS) gebaseerde methode ontwikkeld om de structurele conformatie van het ganse proteoom te onderzoeken. Deze methode steunt op een kortstondig agerend protease dat beschikbare plaatsen op het oppervlak van eiwitten knipt waarna de deels verknipte peptiden uitgelezen worden via MS; beperkte proteolyse (LiP)-MS. LiP-MS werkt op lysaten waarin de structurele conformaties van eiwitten afwijken van deze in cellen vanwege de onvermijdelijke eiwitdenaturatie tijdens het openbreken van cellen. We stellen een methode voor die direct werkt in levende cellen, dit door er een promiscue protease in tot expressie te brengen waarvan de activiteit strak gecontroleerd wordt. Deze methode zullen we toepassen om de invloed van N-terminale acetylering op eiwitconformaties en ligand-geïnduceerde conformatieveranderingen van de glucocorticoïdreceptor te bestuderen.