-
Natural sciences
- Molecular evolution
-
Medical and health sciences
- Virology
- Microbiology not elsewhere classified
De meest intense co-evolutie op onze aarde vindt plaats tussen bacteriën en hun virussen, met name bacteriofagen. Bacteriofagen doden hun bacteriële gastheer met een zeer hoge specificiteit. Elke faaginfectie start door de herkenning van een specifieke structuur op de bacteriële celwand door een receptor-bindend proteïne (RBP). Sommige fagen hebben slechts één RBP en infecteren daarom slechts één serotype, terwijl andere fagen vele gastheren kunnen afdoden met verschillende RBPs. Jumbofagen zijn bijzonder groot en bezitten talrijke RBPs in een complexe organisatie waarmee ze vele bacteriële serotypes kunnen afdoden. Daarom zijn ze ook zeer interessant voor therapie. Faagtherapie is een lang-gekend concept, maar herwint nu sterke interesse om multidrug-resistente bacteriële infecties te behandelen. De meeste jumbofagen zijn nog maar pas ontdekt en zijn nog grotendeels onbekend. Eén van de belangrijkste aspecten is de complexe organisatie van de hypervertakte RBP structuur, de functie en evolutie ervan, en hoe de bacteriële gastheer reageert op jumbofagen in vergelijking met eenvoudige fagen. We zullen deze aspecten bestuderen voor twee specifieke Klebsiella jumbofagen op drie niveaus: het proteïneniveau, het faagniveau en de interactie tussen bacterie en faag. We gebruiken hiervoor geavanceerde moleculaire microbiologie, synthetische biologie en structurele biologie.