Recent is het belang van bacteriële populaties in verschillende lichaamsniches erkend in de diergeneeskunde, echter onderzoek naar het reproductieve microbioom bij honden is schaars. Hondenfokkers beschouwen de aanwezigheid van bacteriën in de geslachtsorganen als een belemmering voor de vruchtbaarheid, waardoor antibiotica vaak worden toegediend tijdens de dekking of rond de bevalling om de vruchtbaarheid en de overlevingskans van pups te verhogen. Antibiotica worden ook routinematig gebruikt in spermaverdunners, die tijdens kunstmatige inseminatie in de vagina of baarmoeder van de teef worden gebracht. Bovendien schrijven dierenartsen vaak antibiotica voor aan teven met vaginale uitvloei zonder bewijs van een bacteriële infectie. Dit onderzoeksproject beoogt (1) een beschrijving van het normale vaginale microbioom bij gezonde teven, wat gekoppeld zal worden aan gewicht, leeftijd en pariteit (2) een vergelijking met het microbioom van teven met vaginitis en (3) onderzoek naar het effect van natuurlijke dekking versus kunstmatige inseminatie met vers en diepvriessperma. Tot slot zullen we mogelijke alternatieven voor antibiotica in spermaverdunners onderzoeken. Door middel van de next-generation Nanopore-sequencingtechnieken zal dit baanbrekende onderzoek het bestaan van het vrouwelijke vaginale microbioom van honden onder verschillende omstandigheden beter definiëren, wat de weg vrijmaakt voor wetenschappelijk onderbouwd en verminderd antibioticagebruik in de voortplanting.