Het menselijke genoom bevat naar schatting ongeveer 20.000 tot 25.000 genen, wat goed is
voor ongeveer 2% van het genomische DNA. Sinds de jaren zestig heeft het resterende 98% of niet-coderende DNA
genoemd "junk" -DNA en er werd gedacht dat het geen moleculaire functie in de cel had.
Onlangs is echter aangetoond dat dit "rommel" -NA DNA een prominente rol heeft in normaal cellulair
functioneert. Het grootste deel van "junk" -DNA wordt actief getranscribeerd in lange niet-coderende RNA's
(LncRNA). Deze lncRNA's oefenen hun functie uit door interactie met andere moleculen, en een
belangrijk mechanisme dat ten grondslag ligt aan de functie van lncRNA betreft de interactie met eiwitten. Over de
afgelopen decennium, meldt een toenemend aantal studies de betrokkenheid van lncRNA's bij de mens
ziekten zoals kanker. Vanwege hun specifieke kenmerken zijn de interacties tussen lncRNA-proteïne hoog
geschikte kandidaten als therapeutische doelen. Echter, de studie van lncRNA-eiwit interacties is
nog in zijn kinderschoenen en robuuste methoden om deze eiwitten te identificeren ontbreken nog steeds. In dit project
We stellen de ontwikkeling voor van een nieuwe en efficiënte methode om lncRNA-interactie te identificeren
eiwitten. In een tweede deel zullen we deze methoden toepassen op een reeks kankerspecifieke lncRNA's. Tenslotte,
we zullen de moleculaire mechanismen achter het lncRNA in zijn relevante kanker ophelderen en valideren
setting. Aan het einde van dit project verwachten we een universeel eiwitidentificatieplatform te hebben
die gemakkelijk kan worden toegepast op elk lncRNA.