Project

Proteoomwijde screening voor eiwitfragmenten die kunnen gesecreteerd worden door gist

Looptijd
01-10-2011 → 30-09-2015
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO), Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Microbiology
    • Systems biology
  • Medical and health sciences
    • Laboratory medicine
    • Microbiology
    • Laboratory medicine
    • Laboratory medicine
    • Microbiology
Trefwoorden
Proteoomwijde screening
 
Projectomschrijving

Verscheidene decennia na de introductie van recombinant DNA technieken voor heterologe eiwitexpressie blijft een kwestie van trial and error of een bepaald nieuw eiwit of eiwitfragment goed zal uiten in een gegeven expressiegastheercel. In dit project ontwikkelen we een nieuwe technologie om de proteoom-wijde bepaling van oplosbare eiwitfragmenten in de gist uitscheiding kan worden geproduceerd inschakelen. Bovendien zal de techniek laten toe die oplosbare eiwitfragmenten afhankelijk van welke proteïne productiesystemen werkwijzen voor hun productie. Binnen het kader van dit project zullen we ons richten op het identificeren van het bereik van de (glyco) proteïnen die afhankelijk zijn van de ER chaperon calnexin voor hun vouwen. We zullen ook onderzoeken hoe secretoire systeem verwerkt kan worden aangepast om het bereik van eiwitfragmenten die met succes kan worden geproduceerd als oplosbare, uitgescheiden eiwitten door de gist secretoire systeem uit te breiden. Als voorbeeld, zullen we bepalen welke eiwitten worden beïnvloed in hun expressie en uitscheiding in gist, waarin de Unfolded Protein Response wordt geïnduceerd. Naast waardoor nieuwe fundamenteel onderzoek naar het functioneren van de eukaryotische secretoire systeem moet uitkomsten van het project is brede nut zijn voor iedereen produceren van recombinante eiwitten voor functionele, structurele of therapeutische studies.