Ulva-soorten, vaak gebruikt als modelsystemen, hebben specifieke bacteriële symbionten die bijdragen aan hun morfogenese en groei. Deze microbiële gemeenschappen kunnen het Ulva-gewas verbeteren door de groei te bevorderen, de biochemische samenstelling te veranderen en te beschermen tegen pathogenen. Succesvolle manipulatie van de microbiota vereist echter een fundamenteel begrip van de dynamiek tussen Ulva en het microbioom.
Dit onderzoek onderzoekt de rol van groei-stimulerende bacteriën in de vroege ontwikkeling van Ulva fenestrata kiemplanten, met behulp van genomics, transcriptomics en metabolomics. Eerst zullen diverse bacteriële stammen die geassocieerd zijn met Ulva worden geïsoleerd en gekarakteriseerd. Gecontroleerde co-cultuurexperimenten zullen de invloed van specifieke bacteriële stammen op de groei en het metabolisme van kiemplanten beoordelen. Met behulp van dual RNA-seq en metabolomics zullen belangrijke metabolische en genetische paden betrokken bij de Ulva-bacterie-interacties worden geïdentificeerd. Ook de invloed van omgevingsfactoren zoals zoutgehalte zal worden onderzocht.
Deze studie biedt belangrijke inzichten in de functionele mechanismen van de Ulva-bacteriële symbiose en heeft potentieel voor toepassingen in duurzame aquacultuur en biomassa-productie.