Project

Vastleggen van het fosforylatie- en interactielandschap van NARK, het centrale kinase dat nodulatie in soja controleert

Code
1280424N
Looptijd
01-10-2023 → 30-09-2026
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Proteins
    • Posttranslational modifications
    • Plant biochemistry
    • Plant cell and molecular biology
    • Plant genetics
Trefwoorden
fosforylering-gemedieerde signalering regulering van nodulatie in sojabonen Kinase
 
Projectomschrijving

Het draait allemaal om balans. De balans tussen de productie van soja, één van de belangrijkste gewassen wereldwijd, en een duurzame omgeving. Ook, de balans die behouden wordt door de sojaplant zelf tussen zijn stikstofvereisten en de energiekosten tijdens nodulatie, een symbiotische interactie met stikstoffixerende rhizobia. De sleutelcomponent is het eiwitkinase NARK. NARK werkt in de scheut om nodulatie te reguleren als reactie op rhizobia, en in de wortels om dit proces te remmen indien er genoeg nitraat voorhanden is. De signalisatiepathway downstream van NARK blijft versluierd. Het doel van mijn project is om te verhelderen hoe nodulatie door NARK gereguleerd wordt, wat mogelijks gebeurt door met naburige eiwitpartners te interageren als reactie op rhizobia en nitraat. Ik zal fosfoproteomics gebruiken om de NARK-afhankelijke eiwitfosforylatie in wortels en scheuten te verkennen, om op die manier mogelijke NARK doelwitten te identificeren. Dit zal gecomplementeerd worden met proximity labeling om het interactienetwerk van NARK bloot te leggen. Nieuwe componenten binnen NARK signalering zullen functioneel gekarakteriseerd worden om hun rol binnen de controle van nodulatie te definiëren. Ik zal ook virus-geïnduceerde gene editing ontwikkelen als een nieuwe functionele genomics methode in soja. Het ontdekken van unieke downstream interactoren van NARK, zal toekomstig onderzoek sturen naar geoptimaliseerde stikstoffixatie met het oog op een duurzamere landbouw.