Project

Exploitatie van innovatieve CRISPR-benaderingen om nieuwe knooppunten in het transcriptionele netwerk van ontwikkelingsgecontroleerde celdood in planten te identificeren

Code
3G008220
Looptijd
01-01-2020 → 31-12-2023
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Plant genetics
Trefwoorden
ontwikkelingsgeprogrammeerde celdood in planten ontwikkeling en differentiatie van wortelkapselcellen transcriptionele genregulatienetwerken
 
Projectomschrijving

Geprogrammeerde Celdood (GC) is fundamenteel voor ontwikkeling van multicellulaire organismen Onze kennis van plant ontwikkelings-gereguleerde GC is fragmentair, ondanks het onbetwistbare belang voor plant groei en voortplanting

Mijn team heeft de Arabidopsis wortelkap als nieuw modelsysteem voor plant ontwikkelings GC tot stand gebracht Dit model heeft het mogelijk gemaakt om sleutelgenen te identificeren die GC controleren in deze context Functionele analyse van deze factoren suggereert een ingewikkeld gen regulatorisch netwerk dat GC controleert als differentiatie stap van wortelkapcellen

Het onderzoeksvoorstel heeft als doel om nieuwe transcriptionele regulatoren in dit hypothetisch netwerk te vinden Transcriptiefactoren zullen geïdentificeerd worden obv een meta-analyse van verscheidene recente experimentele en computationele data sets Kandidaten zullen gescreend worden voor opvallende gain-of-function fenotypes gekenmerkt door verspreide GC na geïnduceerde misexpressie Omgekeerd zal screening voor loss-of-function GC suppressie fenotypes gefaciliteerd worden door innovatieve multiplex weefsel-specifieke CRISPR

Gedetailleerde functionele analyse van kandidaten die gain-of-function of loss-of-function fenotypes geven zal onze kennis van plant ontwikkelings GC regulatie uitbreiden Inzicht in het GC regulatorisch netwerk is een eerste stap tot het erkennen van de complexe controle lagen die GC reguleren als een fundamenteel principe van plant ontwikkeling