Project

Identificatie en karakterisering van nieuwe regulatoren van ontwikkelings-gereguleerde geprogrammeerde celdood in planten

Code
3G004420
Looptijd
01-01-2020 → 31-12-2023
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Plant developmental and reproductive biology
Trefwoorden
ontwikkelingsgestuurde geprogrammerde celldood in planten ontwikkeling wortelkap genetica van de plantenontwikkeling
 
Projectomschrijving

Geprogrammeerde Celdood (GC) is fundamenteel voor de ontwikkeling en gezondheid van multicellulaire organismen Onze kennis van plant ontwikkelings-gereguleerde GC is fragmentair, ondanks het onbetwistbare belang voor plant groei en voortplanting

Mijn team heeft de Arabidopsis wortelkap als nieuw modelsysteem voor plant ontwikkelings GC tot stand gebracht Dit model heeft het mogelijk gemaakt om sleutelfactoren te vinden in een gen regulatorisch network dat GC voorbereiding controleert De moleculaire processen die vitale plantencel functies beeïndigen tijdens de finale stappen van GC uitvoering zijn echter onbekend

Om nieuwe regulatoren van deze stappen in wortelkap GC te identificeren, heb ik een onderzoeksproject bedacht dat individuele cel transcriptoom profilering combineert met forward en reverse genetics Een klassieke  forward genetics screen hanteert een gevoelige fenotypering methode om mutanten met GC suppressie fenotypes te vinden Een innovatieve differentieële enkele cel RNA sequeneringsmethode laat toe om het transcriptoom profiel te bepalen dat voldoende en noodzakelijk is voor GC uitvoering, en om nieuwe kandidaat GC regulatoren te vinden We zullen de kandidaat genen en hun vermoedelijk redundante familieleden bestuderen mbv een baanbrekende weefsel-specifieke multiplex CRISPR methode Dit project zal ons begrip van GC als fundamenteel principe in plant ontwikkeling bevorderen en nieuwe invalshoeken creëren voor verbetering en bescherming van gewassen