CMET is gespecialiseerd in de studie en toepassing van gemengde microbiële culturen of gemeenschappen. Een microbiële gemeenschap bestaat uit verschillende populaties die elk een functionele biologische entiteit en dus een diverse metabolische capaciteit vertegenwoordigen. De assemblage van deze biologische entiteiten vormt - mits goed georganiseerd - een krachtige bron. CMET-onderzoekers richten zich op het optimale beheer van deze microbiële hulpbronnen. We definiëren dit als Microbial Resource Management (MRM), waardoor we nieuwe producten en (technologische) processen kunnen ontwikkelen om ons milieu of de menselijke gezondheid op de meest duurzame manier te verbeteren.

CMET past deze benadering meer specifiek toe op het gebied van de bestrijding en preventie van bacteriële ziekten, toegepaste microbiële ecologie, gastheer-microbiële interactietechnologie, levensondersteunende systemen voor de ruimte, microbiële elektrokatalyse en elektrochemische engineering, terugwinning en valorisatie van hulpbronnen en waterbehandeling en -productie.