Project

De genetische factoren van gewrichtsvorm en hun relatie met gewrichtsbelasting

Code
BOF/IOP/2022/038
Looptijd
01-10-2022 → 30-09-2026
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Analysis of next-generation sequence data
    • Musculo-skeletal systems
  • Engineering and technology
    • Kinematics and dynamics
    • Tissue and organ biomechanics
    • Data visualisation and imaging
Trefwoorden
3D segmentation Mechanische phenotypering Deep learning genoombrede associatiestudie skeletogenese morphometrische phenotypering
 
Projectomschrijving

Recente genoombrede associatiestudies hebben onthuld dat verschillende osteoartritis (OA) risicoloci genetische variaties omvatten die verband houden met musculoskeletale ontwikkeling en morfogenese. Op heden is een grote tekortkoming dat morfometrische fenotypering  gebaseerd is op 2D beeldvorming, resulterend in hoge ruis en beperkte toepasbaarheid. In dit interdisciplinaire project zal DNA worden verzameld van patiënten die voor medische redenen een CT-scan ondergaan. Geavanceerde beeldverwerking en deep learning-methoden zullen worden gebruikt voor 3D-fenotypering en om de associatie tussen SNP-genotype en de gewrichtsvorm en mechanisch fenotype niveau vast te stellen.

De voorgestelde methodologie bouwt voort op de meest recente ontwikkelingen in geometrische deep learning en vormmodellering om betrouwbare schatting van gewrichtsbelasting mogelijk te maken. De bevindingen zullen worden gebenchmarkt bij patiënten met artrose met behulp van een controle cohort van +1200 gevallen.