-
Natural sciences
- Ecology not elsewhere classified
- Parasitology
- Microbiology not elsewhere classified
- Transcriptomics
-
Medical and health sciences
- Analysis of next-generation sequence data
Diatomeeën zorgen voor +20% van de globale primaire productie en zijn belangrijk in nutriëntencycli. Verschillende taxa, waaronder thalassiosiroids, staan bekend om hun 'boom and bust' levensstrategie. Het komen en gaan van hun bloei wordt meestal bestudeerd in de context van abiotische factoren en zoöplanktonbegrazing, terwijl de potentiële impact van pathogenen vaak over het hoofd wordt gezien. In dit project onderzoek ik hoe(zeer) parasitisme door chytriden en abiotische stress de seizoenale successie van diatomeeënsoorten en de bloeidynamiek bepalen. Als modelecosysteem gebruik ik het Belgische deel van het Schelde-estuarium (BPSE), gekenmerkt door sterke licht- en saliniteitsgradiënten en regelmatige chytriden-uitbraken. Ik zal veld- en experimentele studies combineren, gebruikmakend van state-of-the-art, high throughput beeldvormingstechnieken, en moleculaire en bioinformatische benaderingen. Na karakterisering van dominante diatomeeën- en chytridensoorten in cultuur, en laboratoriumexperimenten die processen in het veld nabootsen, zal ik nieuwe instrumenten ontwikkelen om de fysiologische toestand en spatio-temporele dynamiek van thalassiosiroid diatomeeën met een hoge taxonomische resolutie in het wild te bestuderen. Mijn resultaten zullen zeer relevant zijn voor het begrijpen van de rol van ziekten in fytoplankton in de context van klimaatverandering en (de-)eutrofiëring.