Project

Een geïntegreerd functioneel proteomicsplatform voor de studie van normale ontwikkeling en ziekte

Looptijd
01-05-2018 → Lopend
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Biochemistry and metabolism
    • Systems biology
  • Medical and health sciences
    • Medical biochemistry and metabolism
    • Medical biochemistry and metabolism
    • Medical biochemistry and metabolism
Trefwoorden
proteomics
 
Projectomschrijving

De ontrafeling van het menselijke genoom en diermodellen hebben een gigantische impact gehad op studies van normale ontwikkeling, erfelijke ziekten en kanker en maken het nu mogelijk om voor volledige genomen sequentie en genactiviteit te meten alsook alle eiwitten proteomen te bestuderen. Dit biedt een grote uitdaging op het vlak van de controle van de data, in het bijzonder op eiwitniveau. Hierbij worden gericht eiwitten geselecteerd, worden antilichamen uitgetest en geoptimaliseerd en finaal getest op activiteit en hoeveelheid in diverse patiëntstalen, weefselculturen enzoverder. Deze benadering gebeurde tot dusver met standaard eiwit analyze apparatuur maar was zeer tijdrovend en ook vaak niet goed reproduceerbaar. De nieuwe apparaten van Protein Simple, met name de Simple WesTM en Peggy SueTM, laten toe om dergelijke analyses uit te voeren op een veel kleiner aantal cellen en op een veel groter aantal stalen met korte doorlooptijden en zeer robuuste resultaten. Dit innovatieve geautomatiseerde eiwit analyse platform wordt geïntegreerd met een toestel dat toelaat de stalen automatisch op te laden wat snelheid en accuraatheid verder ten goede komt. Ten slotte is er ook een geïntegreerd toestel (Incucyte®) dat in connectie met de te testen eiwitten ook de functionele effecten van hun modulering nagaat door middel van life imaging. Dit geïntegreerd platform zal door meerdere teams gebruikt worden voor een brede reeks van onderzoeksprojecten.