Research Explorer

Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.

Project

Statistische inferentie voor differentiële analyse in single cell transcriptomics

Output en outcomes

Publicaties

Trajectory inference across multiple conditions with condiments

Hector Roux de BézieuxKoen Van den BergeKelly StreetSandrine Dudoit

A1 Artikel in een tijdschrift in NATURE COMMUNICATIONS

msqrob2PTM : differential abundance and differential usage analysis of MS-based proteomics data at the post-translational modification and peptidoform level

Nina DemeulemeesterMarie GébelinLucas Caldi GomesPaul LingorChristine CarapitoLennart MartensLieven Clement

A1 Artikel in een tijdschrift in MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

Quality control for the target decoy approach for peptide identification

Elke DebrieMilan MalfaitRalf GabrielsArthur DeclercqAdriaan StickerLennart MartensLieven Clement

A1 Artikel in een tijdschrift in JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

A guide to trajectory inference and RNA velocity

Philipp WeilerKoen Van den BergeKelly StreetSimone Tiberi

Hoofdstuk in een boek in Single cell transcriptomics : methods and protocols

Normalization benchmark of ATAC-seq datasets shows the importance of accounting for GC-content effects

Koen Van den BergeHsin-Jung ChouHector Roux de BézieuxKelly StreetDavide RissoJohn NgaiSandrine Dudoit

A2 Artikel in een tijdschrift in CELL REPORTS METHODS

satuRn: Scalable analysis of differential transcript usage for bulk and single-cell RNA-sequencing applications

Jeroen GilisKristoffer Vitting-SeerupKoen Van den BergeLieven Clement

A2 Artikel in een tijdschrift in F1000RESEARCH

Trajectory-based differential expression analysis for single-cell sequencing data

Koen Van den BergeHector Roux de BézieuxKelly StreetWouter SaelensRobrecht CannoodtYvan SaeysSandrine DudoitLieven Clement

A1 Artikel in een tijdschrift in NATURE COMMUNICATIONS