Project

Onderzoek naar de belangrijke factoren voor duplicatie-intolerantie in planten

Looptijd
01-01-2019 → Lopend
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Plant biology
Trefwoorden
duplicatie-intolerantie
 
Projectomschrijving

Genomen zijn dynamische entiteiten die in de loop van de tijd veranderen. Een belangrijk mechanisme waarmee genomen
evolueren nieuwe functies is gen en duplicatie van het genoom. Niet alle cellulaire processen zijn dat echter
even flexibel door evolutie door genduplicatie. Studies in menselijke genomen hebben aangetoond
dat bepaalde genen intolerant kunnen zijn voor duplicatie, leidend tot menselijke ziekten. Op dezelfde manier, wij
ontdekte onlangs dat veel genen van bloeiende planten (angiosperm) bij voorkeur als single verschijnen
kopie in alle sequentie van de sequentie van angiosperm genomen. Dit is verrassend gezien de duplicatie-rijke geschiedenis van
de angiospermen. De basis van deze intolerantie voor duplicatie blijft onbekend. Een populair
Hypothese is dat duplicatie van directe invloeden
dergelijke verstoort sleutelroutes waarin deze dosisgevoelige genen zijn betrokken. Alternatief,
vermoedelijke mutaties in de dubbele kopie kunnen interfereren met de essentiële wild-type functie van de
corresponderend gen voor een enkele kopie, zoals het bevorderen van snelle verwijdering of gedupliceerde kopieën van de
genoom. Hier zullen we gebruik maken van de beschikbaarheid van grote collecties of omics-gegevens, om de sleutel te vinden
determinanten die ten grondslag liggen aan intolerantie voor duplicatie. Wij geloven dat het creëren van een diep begrip
in een wijdverspreid evolutionair proces zoals genduplicatie, zullen uitgebreide toepassingen hebben
van het begrijpen van de rol van duplicatie in adaptatie om te begrijpen hoe het kan beïnvloeden
fitness.