Recente ontwikkelingen in gel-vrije proteoom studies zijn gebaseerd op massa spectrometrische identificatie van peptiden gegenereerd door digestie van totale cellysaten. Dergelijke peptiden mengsels zijn vaak bijzonder complex. In dit project worden methoden ontwikkeld om de complexiteit te verlagen met behoud van de representativiteit. Dit houdt ondermeer in dat enerzijds COOH-terminale en anderzijds methionine-houdende peptiden die door Lysine begrensd worden zullen gesorteerd worden.