De lever bestaat voornamelijk uit hepatocyten, sinusoïdale endotheelcellen, stellaatcellen en macrofagen (Kupffer cellen, KCs). Samen vertegenwoordigen deze 4 cellen 90% van alle levercellen. Macrofagen werden lang beschouwd als cellen die enkel belangrijk zijn als bescherming tegen infecties, maar het is nu duidelijk dat macrofagen essentieel zijn voor weefselhomeostase. Transcriptomische profilering heeft onthuld dat elke residente macrofaag een uniek genexpressieprofiel uitdrukt. De precieze cel-cel-communicatie die zorgt voor de expressie van de weefselspecifieke identiteit van macrofagen is onbekend. We veronderstellen dat de cel-cel-communicatie tussen de 4 belangrijkste levercellen niet alleen de blauwdruk vormt van leverhomeostase, maar dat verstoringen in deze cel-cel-interacties leiden tot leverziekten. Het deLIVER-CRISPR-project wil dus ontdekken hoe hepatocyten, endotheel en stellate cellen de KC-identiteit inprenten, maar ook hoe KCs op hun beurt de functionele specialisatie van de andere levercellen beïnvloeden. We zullen geavanceerde technologieën gebruiken, waaronder CUT&RUN, snATAC-seq, in vivo CRISPR-screens en spatial transcriptomics om de belangrijkste cel-cel-interacties te ontrafelen. Het ontcijferen van de wederzijdse cel-cel-interacties waardoor levercellen de sinusoïdale identiteit op elkaar inprenten in vivo, is niet alleen de sleutel tot het begrijpen van de leverbiologie, het effent ook de weg voor de ontwikkeling van in vitro lever organoïden.