Het onderzoek spitst zich toe op het optimaliseren van ecosysteemfuncties van watersystemen, waarbij de impact van watergebruik (bvb drinkwaterwinning, recreatie, irrigatie, landbouw, aquacultuur, …) kwantitatief bestudeerd wordt, en wordt nagegaan hoe en welke functies kunnen worden gecombineerd op een zo gebalanceerd/optimaal mogelijke manier. Dit hangt samen met recente hypes rond ecosysteemdiensten, natuurlijk kapitaal en blue growth. De nadruk ligt op innovatie op het niveau van monitoring, beoordeling, modellering en beheer (bescherming en herstel), waarbij de duurzaamheidsdoelstellingen centraal staan.