Chlamydia abortus infecteert schapen en veroorzaakt ovine enzoötische abortus (OEA). De commerciële geïnactiveerde vaccins hebben een lage efficaciteit en de levende vaccins veroorzaken OEA. 

Wij isoleerden stam 84/2334 bij een papegaai en dachten initieel dat dit Chlamydia psittaci was. Genoomanalyse toonde echter aan dat de stam behoort tot een nieuw aviair C. abortus genotype. Schapen C. abortus stammen hebben geen plasmide maar 84/2334 heeft wel een plasmide, net zoals aviaire C. psittaci. 84/2334 kan bijgevolg genetisch gemanipuleerd worden via zijn plasmide en zo zou een nieuw OEA vaccin gemaakt kunnen worden. Maar alvorens mutant 84/2334 te maken moet onderzocht worden of 84/2334 biologisch gelijk is aan 'schapen C. abortus' en dus bruikbaar is als vaccin. Hiervoor zullen we: i) hun infectiedynamiek (groeikinetiek, live-cell imaging, electronenmicroscopie), ii) hun RNASeq profielen (pathogeen en gastheercel) en iii) modulatie van hun gastheerepigenomen in vitro vergelijken.