Project

Identificatie en evaluatie van potentiële biomarkers voor cellen die latent besmet zijn met HIV

Code
178GE0912
Looptijd
01-10-2011 → 30-06-2016
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: IWT/VLAIO
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Virology
Trefwoorden
HIV Latent
 
Projectomschrijving

Wegens de schaarste aan latent geïnfecteerde HIV-1 cellen bij patiënten worden nu vaak in vitro primaire latentiemodellen gebruikt om het HIV-1 reservoir te bestuderen. Daartoe is een aantal experimentele systemen ontwikkeld. De meeste van deze modellen verschillen op basis van de aard van het primaire CD4+ T-celtype, de gebruikte HIV-stammen, activeringsmethoden en strategieën om de latentie te bepalen. Ondanks deze verschillen hebben de meeste modellen enkele gemeenschappelijke kenmerken. Hier geven we een systematisch overzicht van de primaire HIV-latentiemodellen die tot nu toe zijn gebruikt, met als doel deze modellen te vergelijken en de minimale vereisten voor dergelijke experimenten vast te stellen. Een systematische zoektocht in de databases PubMed en Web of Science leverde een korte lijst op van 17 unieke publicaties waarin nieuwe in vitro latentiemodellen worden voorgesteld. Op basis van de beschreven methoden stellen wij een gegeneraliseerde workflow voor, die alle noodzakelijke stappen visualiseert om een dergelijke in vitro studie uit te voeren, met de belangrijkste keuzes en validatiestappen die moeten worden gemaakt; van celtypeselectie tot het uitlezen van het model.