-
Medical and health sciences
- Hepatology
- Histology
- Cancer therapy
Spatiale single-cell biologie is de medische wetenschappen drastisch aan het veranderen. Dankzij enorme investeringen in spatiale technologieën door academische laboratoria en leveranciers van instrumenten, is het nu mogelijk om de spatiale RNA-, eiwit- en metabolietenexpressie in elke afzonderlijke cel in weefsels te analyseren. Hiermee zal onze kennis van de moleculaire basis van ziekten radicaal veranderen en ons begrip van het werkingsmechanisme van medicijnen sterk verbeteren. Om de spatiale revolutie naar de biomedische industrie te brengen is er echter nood aan (i) kant-en-klare protocollen nodig voor de verwerving van spatiale omics-data en (ii) de ontwikkeling van nieuwe computationele pipelines die spatiale-omics-data efficiënt kunnen analyseren. Handmatige analyse van spatiale omics-data is onrealistisch. Het vereist de ontwikkeling van nieuwe algoritmen op basis van artificiële intelligentie. Het ASAP-consortium zal spatiale omics protocollen en bijpassende merkerpanels ontwikkelen die toepasbaar zullen zijn op commerciële spatiale instrumenten en zal zijn expertise op het gebied van kunstmatige intelligentie inzetten om een nieuw algoritme voor spatiale analyse te ontwikkelen dat spatiale omics-datasets efficiënt kan verwerken. Onze pipeline zal worden getest op een preklinisch levermetastasemodel. We zullen de ASAP-pipeline toepassen om automatisch de therapeutische werkzaamheid van meerdere medicijncombinaties tegen levermetastasen te evalueren en de histopathologische kenmerken, de cellulaire organisatie en de spatiale medicijndistributiepatronen uit de spatiale data te extraheren. De geïntegreerde statistische analyse van deze data zal de effecten van elk geselecteerd medicijn op de tumor en zijn micro-omgeving bepalen en zal veranderingen in cellulaire compositie correleren met de klinische respons. Acht bedrijven zijn toegetreden tot onze adviesraad vanwege het enorme potentieel van het ASAP-project voor hun onderzoek.