Neuroblastoom (NB) is de meest frequente kanker bij zuigelingen en hoog-risicopatiënten hebben, ondanks multimodale behandelingen, een slechte prognose. NB wordt aangestuurd door DNA copy nummer variaties (CNVs) en hoog-risico tumoren zijn gekarakteriseerd door amplificaties in het MYCN oncogen, wat leidt tot verhoogde replicatiestress. De labo’s van mijn promotoren hebben de ALK/ATR/CHK1/RRM2 replicatiestress signaleringsas recent geïdentificeerd als een therapeutisch doelwit met veelbelovende resultaten in NB modelorganismen. Dit PhD project heeft als doel om de onderliggende mechanismen van deze succesvolle combinatiebehandelingen te doorgronden in hoog-risico NB muis modellen. Aangezien ons recent onderzoek een rol van zowel het immuun stelsel als cellulaire differentiatie suggereerde, zal ik door middel van spatiële transcriptoom (ST) analyse bepalen hoe deze responsen (ruimtelijk) gerelateerd zijn en verschillen tussen de behandelingen. Om op de meest accurate manier te bepalen hoe CNVs bijdragen aan deze responsen zal ik daarnaast een benchmark verrichten van beschikbare algoritmes en deze meer aangepast maken voor ST analyse. Gezien de beeldvorming laag van ST data en het belang van visualisatie hiervan zal ik de genereerde ST data centraliseren met andere studies en beschikbaar maken in een interactieve webapplicatie.