Project

Unipept Next: een flexibelere, differentiële Unipept voor verwerking van multi-omics datasets

Code
01P10623
Looptijd
01-11-2023 → 31-10-2026
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Data visualisation and high-throughput image analysis
    • Proteomics
  • Medical and health sciences
    • Development of bioinformatics software, tools and databases
Trefwoorden
Metaproteomics differentiële gegevensanalyse proteogenomics
 
Projectomschrijving

"Metaproteomics is een uitermate geschikte tool voor taxonomische en functionele analyse van een complex ecosysteem. Dit veld evolueert snel en de grootte van (en hoeveelheid aan) metaproteomics datasets die verwerkt moeten worden, neemt steeds meer toe en er duiken steeds weer nieuwe uitdagingen op. Unipept (https://unipept.ugent.be) is een van de belangrijkste tools voor de analyse van metaproteoom-data analyse die het voor onderzoekers mogelijk maakt om zowel taxonomische als functionele informatie uit omgevingsstalen te extraheren. Om de evolutie die dit veld meemaakt te kunnen bijbenen, moeten we een antwoord vinden op de uitdagingen die we vandaag tegenkomen en op die manier Unipept klaarstomen voor de volgende generatie van metaproteoom-onderzoek. Om Unipept voor te bereiden op een transitie die momenteel plaatsvindt in het laboratorium, zullen we analyses op basis van arbitraire peptideformaten mogelijk maken. Daarnaast zullen we, door nieuwe statistische technieken voor de vergelijking van meerdere datasets te ontwikkelen, tegemoet komen aan de toenemende vraag van onderzoekers om de impact van micro-organismen op ecosystemen beter te kunnen bestuderen en begrijpen. Ten slotte, wil ik Unipept ook nog utbreiden om de analyse van metagenoom- en metatranscriptoom-data mogelijk te maken. Dit zal ervoor zorgen dat Unipept dé universele tool voor de analyse van meta-omics datasets kan worden."